Молокане были читающими христианами - у них пользовались популярностью книги Г.С. Сковороды "Библиотека духовная" (изд. 1798 г., СПб), "Дружеский разговор о душевном мире" (изд. 1837, Москва), книга немецкого богослова Юнга Штиллинга "Победная повесть христианской веры" и некоторые другие. Богослужения молокан представляли собой уже не хлыстовские радения в "кораблях", а чистое чтение Библии и пение отдельных библейских текстов или псалмов, преимущественно из Псалтиря. Читающие Библию могли толковать прочитанное, произнося таким образом, евангельские проповеди.
Собирались молокане в своих домах. Они, читая Библию, справедливо находили в ней основания для полного отрицания православных таинств, икон, культа мощей и святых. Молокане отвергали пышную иерархию православия, заявляя, что у них "один Архиерей - Иисус Христос, все люди братья, все равны по благодати. Душа человеческая есть образ Божий, лик небесный" Духовные христиане - молокане образовывали общины, руководили общинами выборные пресвитеры - наставники, которые исполняли свое служение бесплатно по слову Христа: "даром получили - даром давайте" (Матф. 10:8). Они совершали обряды венчания, похорон, но деньги за это им брать запрещалось. Не понимая вполне евангельского учения о водном крещении, молокане частью крестили младенцев, частью не крестили вовсе, заявляя, что они получили крещение духовное. Совершение любого обряда состояло в чтении определенных мест Священных Писаний и пения псалмов из Библии.
Кроме пресвитера, у руководства общиной стояли его помощники - совет стариков, которых избирала община из числа наиболее достойных своих членов.