В обществе христианской молодёжи молодой казак познакомился с 19-летней Екатериной Башкировой. Екатерина Афанасьевна Башкирова родилась 15 июля 1888 года в с. Утешино, в Башкирии, недалеко от Уфы. Ее отец был машинистом на железной дороге. Затем семья переехала в Среднюю Азию и поселилась в Кизил-Аравате. В Ташкент она приехала учиться на акушерку, также пришла к вере и стала членом Ташкентской церкви. . В тот же день вместе с ним была крещена Екатерина Афанасьевна, в ту пору добрая и скромная девушка. Через какое-то время они решили, что в будущем станут мужем и женой.
Никита Черкасов заявил войсковому начальству о своём обращении в веру и о том, что теперь, согласно своих убеждений, он не может больше носить оружие. Он решил не только не поступать в юнкерское училище, чтобы быть офицером, но и отказался совсем от царской военной службы, ибо видел несправедливость и заносчивость офицеров, которые грубо и жестоко обращались со своими подчинёнными. Об этом он подал командиру 5-го Оренбургского полка, полковнику Гурьеву, докладную записку, в которой подробно указал свои религиозные мотивы. В то время сотни духоборцев и других евангельских христиан уже сидели в тюрьмах, отбывая наказание за отказ служить в армии с оружием в руках. Войсковое начальство сделало всё возможное, чтобы отвернуть казака Черкасова от «штундизма», но он оставался верным своим убеждениям. Командир полка приказал арестовать его за упорный отказ от военной службы царю. Он был арестован и посажен в полковое арестное помещение. Это случилось в январе месяце 1908 года, в то время, когда в Ташкенте восставали сапёрные батальоны, усмирителем которых был 5 Оренбургский казачий полк. Впоследствии над Никитой учинили большое следствие, причём его обвинили за отказ от военной службы не на основании религиозных убеждений, а якобы на основании политических соображений и в обвинительном акте выставлялась статья, по которой он должен быть осуждён к лишению всех прав и ссылке на каторжные работы. Между тем Никита Черкасов никогда политическими вопросами не занимался и ни к какой политической партии не принадлежал.