В правление царевны Софьи в 1684 году принимается указ, по которому людей, не ходивших в церковь, не принимавших причастия и не пускавших в дом священника, подвергали пыткам, а нераскаявшихся - сжигали на кострах.
Законы Петра I предусматривали за непочтительные высказывания о церкви смертную казнь с предварительным прижиганием богохульного языка раскаленным железом. Пытки, наказание кнутом, ссылки на каторжные работы в таких случаях были обычной практикой. Впрочем, нужно сказать справедливости ради, что Петр I не особенно жаловал и православную церковь - он рассматривал ее, скорее, как инструмент для своего владычества. Чтобы исключить возможный конфликт между церковью и государством, Петр I, опираясь на помощь известного церковного политического деятеля, священника и философа в одном лице, Феофана Прокоповича, упразднил в 1721 году патриаршество и определил руководство православной церкви в виде Духовного Коллегиума, который стал впоследствии именоваться Святейшим Правительствующим Синодом. Обер-прокуроры, как правило, были люди не духовного звания. "Святейший" Синод был инициатором многих драконовских законов против людей иной, не православной, не официальной веры - против раскольников и сектантов. Большинство этих законов были тайными, но всегда скрепленными подписью царя. Эти постановления циркулярно рассылались всем губернаторам и администраторам, которые должны были их выполнять, сохраняя их существование, между тем в строжайшей тайне. Таких секретных предписаний, согласно данных Бонч-Бруевича, было в царствование:
Анны Иоановны (1730-1740) - 1
Екатерины II (1762-1796) - 8
Павла I (1796-1801) - 3
Александра I (1801-1825) - 59